企業新建項目在試運行階段，可能會產生實際的排污行為。根據相關法律要求，企業必須持證排污，不得無證排污。因此，企業在投入運行并產生實際的排污行為之前，應當取得排污許可證。這跟企業是否通過環保驗收沒有必然的關系。排污許可證是對企業實際排污行為的許可，根據《建設項目環境保護管理條例》，試生產行為在竣工驗收之前，需要試生產的企業，不能等到驗收之后才申請許可證。不僅如此，哪怕企業連“試生產”都還沒有正式開始，只是在調試階段，但只要有實際的與生產相關的污染物產生了——即便污染物的類型、排放量跟正常運行之后不一樣，企業都必須在此之前獲得排污許可證。此外，企業在申請排污許可證的時候，竣工驗收報告并不是前置條件，但是需要提交環評報告的批復文件。

因此，環評是首位的，而申請排污許可證需要在發生實際排污行為之前；而一旦裝置運行（試生產、試運行）就會排污，所以排污許可申請需要在環保驗收之前完成，且必須已經取得環評批復（或完成登記表備案）。應急預案是投入使用前完成，那么自然是在試運行之前。

綜上，可以總結出以下這個流程：環評編制——取得環評批復（或完成登記表備案）——申請排污許可證——編制環境風險應急預案——試運行——開展竣工環保驗收——完成自主驗收——正式投產。